PmrA motif model
For every instance is indicated whether this instance contributed to the motif model (motif model) or whether it was found by screening afterwards with the motif model (screening).
| Gene |
Genome |
Start |
End |
Instance |
| udg (motif model) |
|
| ECs2829 |
NC_002695 |
-163 |
-145 |
TGCTTAATATTAACTTAAT |
| udg |
NC_003197 |
-163 |
-145 |
TGCTTAATATTAACTTAAT |
| ugd |
NC_000913 |
-163 |
-145 |
TGCTTAATATTAACTTAAT |
| ugd |
NC_002655 |
-163 |
-145 |
TGCTTAATATTAACTTAAT |
| ugd |
NC_003198 |
-163 |
-145 |
TGCTTAATATTAACTTAAT |
| ugd |
NC_004431 |
-163 |
-145 |
TGCTTAATATTAACTTAAT |
| yfbE (motif model) |
|
| ECs3141 |
NC_002695 |
-85 |
-67 |
TTCTTAAGGTTAAGTTAAT |
| STY2527 |
NC_003198 |
-100 |
-82 |
TTCTTAATGTTAATTTAAT |
| YPO2422 |
NC_003143 |
-139 |
-121 |
TTCCTAAGGTTCATTTAAG |
| Z3511 |
NC_002655 |
-85 |
-67 |
TTCTTAAGGTTAAGTTAAT |
| b2253 |
NC_000913 |
-85 |
-67 |
TTCTTAAGGTTAAGTTAAT |
| y1917 |
NC_004088 |
-139 |
-121 |
TTCCTAAGGTTCATTTAAG |
| yfbE |
NC_003197 |
-100 |
-82 |
TTCTTAATGTTAATTTAAT |
| yfbE |
NC_004337 |
-118 |
-100 |
TTCTTAAGGTTAAGTTAAT |
| yfbE |
NC_004431 |
-85 |
-67 |
TTCTTAAGGTTAAGTTAAT |
| yibD (motif model) |
|
| ECs4493 |
NC_002695 |
-68 |
-50 |
GGCTTAATAGTTTCTTAAT |
| STY4088 |
NC_003198 |
-70 |
-52 |
GGCTTAATAGTTTCTTAAT |
| yibD |
NC_000913 |
-68 |
-50 |
GGCTTAATAGTTTCTTAAT |
| yibD |
NC_002655 |
-68 |
-50 |
GGCTTAATAGTTTCTTAAT |
| yibD |
NC_003197 |
-70 |
-52 |
GGCTTAATAGTTTCTTAAT |
| yibD |
NC_004431 |
-68 |
-50 |
GGCTTAATAGTTTCTTAAT |
| yjdB (motif model) |
|
| ECs5096 |
NC_002695 |
-36 |
-18 |
AACTTAAGGTTGGCTTAAT |
| STY4492 |
NC_003198 |
-66 |
-48 |
TTCTTAAGGTTCACTTAAT |
| yjdB |
NC_000913 |
-36 |
-18 |
AACTTAAGGTTGGCTTAAT |
| yjdB |
NC_002655 |
-36 |
-18 |
AACTTAAGGTTGGCTTAAT |
| yjdB |
NC_003197 |
-66 |
-48 |
TTCTTAAGGTTCACTTAAT |
| yjdB |
NC_004337 |
-21 |
-3 |
AACTTAAGGTTGGCTTAAT |
| yjdB |
NC_004431 |
-21 |
-3 |
AACTTAAGGTTGGCTTAAT |
| y1960 |
NC_004088 |
-451 |
-433 |
TCTTAAGGATTAACCTAAT |
| YPO2377 |
NC_003143 |
-48 |
-30 |
TCGATATTCTTTAGGTAAT |
| STM1269 (screening) |
|
| STM1269 |
NC_003197 |
-63 |
-45 |
TACTTAATGTTATCTTAAT |
| aroQ |
NC_003198 |
-63 |
-45 |
TACTTAATGTTATCTTAAT |
| ais (screening) |
|
| ais |
NC_003197 |
-65 |
-47 |
TGCGGAATTTCATTTTAAT |
| ybjG (screening) |
|
| ybjG |
NC_003197 |
-190 |
-172 |
ACTTTAAGGTTAATTTAAG |
| ybjG |
NC_003198 |
-190 |
-172 |
ACTTTAAGGTTAATTTAAG |
| ygiW (screening) |
|
| STY3353 |
NC_003198 |
-58 |
-40 |
TTGTTAAGGATTACCTTAT |
| ygiW |
NC_003197 |
-58 |
-40 |
TTGTTAAGGATTACCTTAT |
| yijP (screening) |
|
| yijP |
NC_003197 |
-66 |
-48 |
TGCTTCAGATTCTTTTAAG |
| yijP |
NC_003198 |
-66 |
-48 |
TGCTTCAGATTCTTTTAAG |
| yegH (screening) |
|
| yegH |
NC_003197 |
-262 |
-244 |
AGATTAATATTAAATGAAT |
| yegH |
NC_003198 |
-262 |
-244 |
AGATTAATATTAAATGAAT |